那是在很久很久以前,在瑪那女神誕生之前的故事。
從一個不知在何處的遙遠次元而來的一位大魔女,將世界陷入黑暗之中,
魔女之名為雅妮絲(アニス)。
魔女雖被守護著樹的守護者討滅,但是,據說那個黑暗的詛咒,貫穿了許多次元,降臨在所有的世界中。
然後,世界還未訴說其他的傳說。
之前,世界被黑暗所封閉之時,瑪那的女神用瑪那之劍,打倒了導致世界毀滅、化身為災難的神獸,並以此封印了八顆要石。
黑暗離去了。然後,世界的創造,開始進行了。
在那之後的女神,化為一顆年老的大樹,在不為人知的遙遠聖域,瑪那之樹和瑪那之劍,據說到現在仍持續地守護著世界。
然後,流逝了多少的歲月,世界被寧靜所包圍。
現在,恐怖的黑暗之帳又降臨了世界。
南海小島的古都──培丹(ペタン)……
那冰冷又銳利的魔爪,打算撕裂平靜世界的睡眠……
主角羅傑(ロジェ),是個有著開朗、外向的個性,同時也具有優秀的劍術和體術技能的少年。身為培丹王國的住民,他因為兩年的義務兵役而服役於培坦軍。不斷地從事訓練以及討伐魔物的工作。
大魔女雅妮絲這個角色,曾出現在《聖劍LOM》(聖剣伝説 Legend of Mana)中的世界事典、及《聖劍4》(聖剣伝説 4)。在《聖劍LOM》世界的次元中,雅妮絲是個破壞瑪那之樹、並製作出威力強大的「火石」的人。火石是雅妮絲為了想要得到力量而製作出的強大魔法之源的代替品,可說是仿造神話時代,瑪那女神交給六色的月神的石頭的人工加工品;在《聖劍4》中,雅妮絲是被邪惡的大樹之聲所惑,進而開啟魔界之門,使世界陷入黑暗時期的千年前的大樹的巫女。